慢性病管理軟件系統是打造縣域慢病管理中心的重要工具，也是促進縣域醫院和醫生團隊對慢性病患者監管有效性的關鍵內容。

慢性病管理軟件系統與一般的HIS、LIS等管理系統不同，而是根據慢病管理邏輯研發的，覆蓋慢病管理全生命周期的，按照醫療衛生機構以及工作人員的責任劃分，為縣域慢性病管理帶來支持的軟件系統。

從慢性病管理軟件系統的主要功能看，它具有監控、干預、分析、統計等內容。

監控是管理縣域內重要慢病患者信息的功能，如：患病信息、診療信息、隨訪信息、管理信息等。

干預是指按照慢病患者情況，根據不同的階段，為慢病管理工作人員和患者提供診治及管理支持，如：檢測、輔助診斷、隨訪、復診、就醫和宣教、質控等。

分析是依托于慢病管理有關的診治與運營數據，對范圍內重要慢性病管理情況進行分析，如：慢病管理趨勢、管理現狀與標準、效益、費用、任務量等。